288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2086 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 358 aa  720    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  42.02 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  41.49 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  32.34 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  28.66 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6879  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0423677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  44.12 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  41.77 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 244 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 237 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  50.91 
 
 		 236 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 236 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 238 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3872  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.600353  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  31.33 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00705  putative transcription regulator protein  27.69 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0312291  normal  0.40859 
 
 
-
 
NC_003296  RS04697  putative transcription regulator protein  30.11 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 246 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 245 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 212 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 247 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 223 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 245 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 231 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 237 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 211 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 211 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 256 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 246 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 229 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  34.18 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  26.47 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  40.98 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 227 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0611  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600848  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  28.42 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  38.04 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  41.54 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.93 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 230 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0914  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>