256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05438 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  41.75 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3872  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.600353  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_003296  RS00705  putative transcription regulator protein  39.86 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0312291  normal  0.40859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3072  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0364  GntR domain-containing protein  38.35 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6189  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6879  GntR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0423677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4554  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04697  putative transcription regulator protein  36.96 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1958  GntR domain protein  28.3 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  27.21 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  25.52 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  25.6 
 
 		 224 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  25.36 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  23.38 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  25.35 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 393 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  25.27 
 
 		 218 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 238 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  27.19 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  29.73 
 
 		 237 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  30.48 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0360  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3666  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 157 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  24.4 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  25.36 
 
 		 228 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 228 aa  49.7  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 226 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 226 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  24.24 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  22.63 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  22.43 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  40 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2213  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 474 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157881  normal  0.27822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  25.66 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>