117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00705 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00705  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0312291  normal  0.40859 
 
 
-
 
NC_003296  RS04697  putative transcription regulator protein  85.23 
 
 		 298 aa  474  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6879  GntR family transcriptional regulator  81.69 
 
 		 297 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0423677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3872  GntR family transcriptional regulator  72.97 
 
 		 311 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.600353  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6189  transcriptional regulator, GntR family  72.3 
 
 		 298 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4554  GntR family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  39.86 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  42.39 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0364  GntR domain-containing protein  42.26 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3072  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  27.89 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  26.74 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 230 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 234 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  28.11 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  26.69 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.57 
 
 		 228 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  38.46 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 219 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  41.54 
 
 		 221 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  25.29 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  27.22 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  25.24 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  27.22 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  29.08 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  25.28 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5197  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477284  normal  0.133192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  39.68 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.99 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  23.74 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1958  GntR domain protein  25.8 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  23.33 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  24.86 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  22.54 
 
 		 243 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  20.79 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4006  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  43.55 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  38.1 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>