More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0611 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0611  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600848  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3676  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3411  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.632381 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.36 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.23 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  40.15 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.28 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.09 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  44.27 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.12 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  30.81 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30.3 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.16 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>