More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5798 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  33.77 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  32.62 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  45.45 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  44.32 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  46.48 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  40.18 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.01 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  41.46 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  43.04 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>