More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3006 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3006  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1164  regulatory protein GntR, HTH  43.78 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2749  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal  0.715519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1816  regulatory protein, GntR  39.73 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0697893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44690  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0330789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3807  putative transcriptional regulator  40.83 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3659  transcriptional regulator, GntR family  39.55 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3603  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.487486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3841  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4277  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.995152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1591  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1798  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 261 aa  98.2  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0504  regulatory protein GntR, HTH  30.12 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2403  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0235  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31340  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  28.1 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4803  transcriptional regulator, GntR family  41.05 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3048  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  38.27 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  38.95 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  38.27 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>