More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44690  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0330789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3807  putative transcriptional regulator  98.63 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2749  GntR family transcriptional regulator  78.08 
 
 		 219 aa  352  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal  0.715519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1816  regulatory protein, GntR  69.12 
 
 		 219 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0697893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3659  transcriptional regulator, GntR family  70.37 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1798  GntR family transcriptional regulator  67.28 
 
 		 219 aa  291  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3841  GntR family transcriptional regulator  68.2 
 
 		 219 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3603  GntR family transcriptional regulator  68.2 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.487486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1591  GntR family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4277  GntR family transcriptional regulator  67.28 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.995152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1164  regulatory protein GntR, HTH  44.2 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3006  regulatory protein GntR, HTH  40.37 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0504  regulatory protein GntR, HTH  30.09 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0235  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  34.31 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2403  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  44.87 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  41.76 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  28.4 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  28.93 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>