More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1164 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1164  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3006  regulatory protein GntR, HTH  43.78 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2749  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal  0.715519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3807  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44690  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 219 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0330789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1816  regulatory protein, GntR  43.95 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0697893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1798  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3659  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1591  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3841  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4277  GntR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.995152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3603  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.487486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0504  regulatory protein GntR, HTH  29.86 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0235  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  47.47 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2403  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 96 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3081  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  22.93 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  43.59 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  39.25 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  44.32 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.04 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  34.57 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  27.15 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  37.36 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  31.67 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>