More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0504 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0504  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 219 aa  453  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3659  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3603  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.487486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1816  regulatory protein, GntR  33.8 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0697893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1798  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4277  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.995152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3841  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1591  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2749  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal  0.715519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44690  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0330789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3807  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1164  regulatory protein GntR, HTH  29.86 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3006  regulatory protein GntR, HTH  30.12 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0235  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  24.5 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  36.26 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2403  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 96 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  22.42 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  23.53 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 284 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  24.39 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3048  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  25.98 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  37.5 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  24.32 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>