More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2767 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3841  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1591  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4277  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.995152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3603  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.487486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44690  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0330789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3807  putative transcriptional regulator  35.75 
 
 		 219 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1798  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 219 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3006  regulatory protein GntR, HTH  37.28 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3659  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2749  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal  0.715519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1816  regulatory protein, GntR  34.41 
 
 		 219 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0697893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1164  regulatory protein GntR, HTH  33.52 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 231 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4803  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 219 aa  85.5  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.55 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0235  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2403  GntR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.12 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3048  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  46.74 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.16 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  26.32 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  32.29 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  38.75 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  34.33 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>