More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4803 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4803  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3048  GntR family transcriptional regulator  82.96 
 
 		 225 aa  343  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 396 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1173  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3081  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  34.9 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.55 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  38.24 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  27.48 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  33.56 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  31.28 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  30.63 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>