More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3340 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  88.94 
 
 		 233 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  89.86 
 
 		 233 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.05 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.02 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  26.4 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5865  GntR domain-containing protein  33.16 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4982  GntR domain protein  32.45 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.62 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  30.5 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  36.31 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  32.54 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  32.98 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  35.88 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  35.88 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  32.21 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.67 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  30.98 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.57 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  31.73 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  31.19 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.69 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1719  GntR domain-containing protein  32.34 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  hitchhiker  0.00929417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.85 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  32.41 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  31.92 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  32.69 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2228  regulatory protein GntR HTH  29.15 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.814458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  30.53 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  30.15 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.85 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.02 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  32.5 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  29.02 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  29.02 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.02 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.18 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  29.02 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  30.77 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.02 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.02 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2215  regulatory protein GntR HTH  28.12 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  32.11 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  30.2 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  31.28 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  31.03 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  34.25 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  27.62 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  29.3 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.06 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  26.5 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  31.87 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.94 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  33.54 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  31.47 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>