More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4081 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  78.33 
 
 		 263 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  80.61 
 
 		 263 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  62.21 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  40.23 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  41.53 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  43.04 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  44.84 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  39.74 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 317 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  34.5 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  34.2 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  37.84 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  32.43 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  31.76 
 
 		 501 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  30.34 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  30.04 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  29.44 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  29.66 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  27.8 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  25.12 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  31.12 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.51 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  30.61 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  30.1 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  29.24 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  29.63 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  29.3 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  30.86 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.92 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.9 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  27.39 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  29.18 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  29.18 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  28.51 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  32.37 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  33.06 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  27.23 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  29.02 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  27.66 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  27.66 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  27.66 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  34.76 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  27.09 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  30.54 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  30.56 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  30.56 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>