More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3125 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  54.82 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.22 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 218 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.63 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  40.13 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.22 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.5 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30.14 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  30.6 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.51 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 366 aa  95.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.64 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  26.43 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.93 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.93 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  37.25 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.65 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.73 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.58 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.37 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.34 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.83 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.62 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  32.88 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.19 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  34.83 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  37.56 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 261 aa  85.5  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  31.46 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.64 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  33.5 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  34.83 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  26.58 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  32.99 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  30.93 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  32.59 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  32.11 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  32.43 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.7 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  29.63 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  32.57 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  32.57 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  32.57 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  32.57 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  29.09 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  27.35 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  25.11 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>