More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0666 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  66.95 
 
 		 243 aa  317  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0179  GntR family transcriptional regulator  68.24 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  40.26 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  37.93 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2470  transcriptional regulator, GntR family  39.72 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  38.67 
 
 		 239 aa  131  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3768  regulatory protein GntR HTH  34.89 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  37.79 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  37.79 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08380  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  33.77 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.26 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.86 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  31.63 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  30.49 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.7 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  30.9 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.52 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.49 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.3 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  29.44 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  31.36 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  34.52 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.48 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.46 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  32.57 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  29.95 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  29.86 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  31.73 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.71 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  32.94 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  30 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  27.41 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  30.22 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  26.58 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  31.67 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  27.78 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  32.94 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  31.22 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  25.48 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  29.44 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  28.74 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  28.11 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  30.29 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  27.24 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.69 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.69 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.69 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.69 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.69 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  26.61 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  31.4 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  28.1 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  31.61 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  33.54 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  25.78 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  28.85 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  29.51 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  27.46 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  27.46 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.44 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  27.46 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.58 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.19 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>