More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0179 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0179  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  77.41 
 
 		 243 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  68.24 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  40.95 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2470  transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  37.56 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  37.09 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  34.51 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3768  regulatory protein GntR HTH  31.82 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08380  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  32.31 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  36.68 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.23 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.43 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.77 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  30.45 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  33.01 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  30.73 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.67 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  30.7 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  30 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.48 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.91 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.98 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.48 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  28.24 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.82 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  30.08 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  25.69 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  31.16 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  32.23 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  29.63 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.79 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  35.86 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  26.26 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  28.96 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.54 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  29.02 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.7 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  28.18 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  29.78 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  27.31 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  28.64 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  28.7 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  34.19 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  29.13 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  29.3 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  39.47 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  30.37 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  24.65 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.29 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.14 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  30.46 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.79 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  29.92 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  31.53 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>