More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0212 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  71.81 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  74.8 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  73.6 
 
 		 254 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  66.79 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  36.05 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  35.22 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  33.63 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  34.51 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.62 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 232 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  35.19 
 
 		 291 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  35.06 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  35.06 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  34.47 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.78 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  33.46 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  33.86 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  33.59 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  33.59 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  33.59 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  35.4 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.6 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  29.73 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  29.73 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  29.73 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  29.73 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  29.73 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.04 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.51 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  31.48 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  29.06 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.89 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  33.18 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  32.3 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.71 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  30.93 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  34.56 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  30.7 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  35.11 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  33.94 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.94 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.04 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  35.45 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.87 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.53 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  32.12 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>