More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0223 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0223  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0229  GntR family transcriptional regulator  87.67 
 
 		 232 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4629  GntR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 221 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.470716  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4615  GntR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.26 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3081  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  44.71 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  31.66 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  26.29 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  21.18 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  31.21 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  30 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  41.05 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  38.04 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>