More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2411 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2619  putative GntR family regulatory protein  100 
 
 		 294 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  normal  0.158643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2460  putative GntR family regulatory protein  99.66 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0419984 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2411  putative GntR family regulatory protein  100 
 
 		 294 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0408929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2515  putative GntR family regulatory protein  100 
 
 		 294 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249401  normal  0.14976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  88.65 
 
 		 232 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 236 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  23.47 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  26.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  27.41 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  26.26 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  28.23 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  25.36 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  24.63 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.13 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  25.6 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  27.14 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  23.62 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>