More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1174 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1173  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4803  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3048  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 262 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  32.47 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  33.01 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.11 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>