More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1632 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  88.34 
 
 
223 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  87 
 
 
223 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  87 
 
 
223 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  87.44 
 
 
223 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  86.55 
 
 
223 aa  400  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  87 
 
 
223 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  87 
 
 
223 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  86.1 
 
 
223 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  70.85 
 
 
223 aa  340  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
230 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
223 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 
219 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
229 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
226 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
255 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
235 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
229 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 
231 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  26.32 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
243 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
256 aa  89  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  26.76 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  29.9 
 
 
234 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
239 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 
240 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 
238 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
229 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  25.48 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 
230 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
250 aa  82  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>