More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1411 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  71.75 
 
 
223 aa  345  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  72.2 
 
 
223 aa  345  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  72.2 
 
 
223 aa  345  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  72.2 
 
 
223 aa  345  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  72.2 
 
 
223 aa  345  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  70.85 
 
 
223 aa  340  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  71.3 
 
 
223 aa  340  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  71.3 
 
 
223 aa  338  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  70.85 
 
 
223 aa  335  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
230 aa  112  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
225 aa  104  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 
219 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
255 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
229 aa  98.2  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
241 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  27.37 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
229 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  23.92 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
235 aa  91.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
239 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  26.88 
 
 
231 aa  89  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  25.13 
 
 
263 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
227 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.19 
 
 
237 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 
274 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.68 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
235 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
241 aa  84.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
232 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  26.15 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  25.35 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.04 
 
 
233 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>