More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0431 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  50.88 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2902  GntR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  42.35 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  40.09 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  39.15 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  40.48 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  38.92 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.94 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.94 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.94 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.48 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  33.48 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.58 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 226 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  35.18 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 218 aa  95.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 220 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.41 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.4 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>