More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2101 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  62.5 
 
 
219 aa  262  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  46.98 
 
 
221 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.91 
 
 
221 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  46.73 
 
 
221 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  46.73 
 
 
221 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  46.73 
 
 
221 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  46.73 
 
 
221 aa  191  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.26 
 
 
221 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  46.26 
 
 
221 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
240 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
239 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  35.29 
 
 
238 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  34.05 
 
 
226 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  34.05 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
227 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
245 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
237 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
217 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  31.9 
 
 
237 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1721  transcriptional regulator, GntR family protein  60.22 
 
 
97 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
248 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 
234 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 
234 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
249 aa  98.2  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  32.41 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
219 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
243 aa  92  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 
218 aa  92  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 
221 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
236 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
236 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 
226 aa  89  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
215 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  30.81 
 
 
240 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
262 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  28.66 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.17 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 
227 aa  72  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  26.37 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>