More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_19990 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_19990  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
233 aa  470  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
227 aa  248  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  59.43 
 
 
219 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  45.23 
 
 
227 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  39.05 
 
 
242 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  27.32 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2647  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.895609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  39.58 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
211 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  26.71 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
211 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3670  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  32.52 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.22 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  32.3 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>