More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7518 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19990  transcriptional regulator, GntR family  45.28 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  43.41 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  44.5 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.28 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.93 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  30 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.81 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>