More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3609 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 227 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19990  transcriptional regulator, GntR family  59.43 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  44.88 
 
 		 242 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 238 aa  91.7  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.94 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.57 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  27.22 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  27.78 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3670  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  29.06 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>