More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3670 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3670  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  95.76 
 
 		 236 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2693  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2647  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.895609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  31.43 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0257  GntR domain protein  30.85 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  32.67 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  42 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  28.84 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  31.61 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  39.05 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  37.66 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>