More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6375 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6608  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0123942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6206  GntR family transcriptional regulator  99.54 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00935659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0695  GntR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  49.51 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  49.76 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 228 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 216 aa  89  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  31.28 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.74 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 221 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.78 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  28.64 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>