More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4555 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  37.92 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  39.51 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  41.56 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 317 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  43.59 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  43.67 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  35.68 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  37.92 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  35.57 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  32.5 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  34.07 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.7 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  32.8 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  35 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  37.2 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  30.33 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  29.25 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 238 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  34.97 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  24.89 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  33.92 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  28.8 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  25.65 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  30.93 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  45.36 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.69 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  27.85 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.61 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  29.07 
 
 		 501 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  28.46 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.69 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  31.2 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  31.1 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  23.95 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  32.54 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  26.48 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  31.68 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  24.38 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  27.51 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  32.98 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  26.38 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  27.9 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  30.81 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  34.21 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.09 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  23.68 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  25.94 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  28.33 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  27.47 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  28.81 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  26.25 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  30.18 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  35.94 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  29.15 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  30.25 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  23.68 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>