More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4617 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  42.32 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  41.3 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  45.73 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  37.92 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 302 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  37.9 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  35.17 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  33.19 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  39.18 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  39.18 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  33.47 
 
 		 275 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.91 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.07 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  34.25 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  31.08 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  29.13 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  34.13 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.2 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  30.57 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  35.4 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  38.05 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  34.76 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  38.05 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  38.05 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  30.81 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  26.83 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  28.99 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  29.57 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  29.57 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.65 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  38.39 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.66 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  31.36 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  26.75 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.66 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.23 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  45.83 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  26.75 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  37.17 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1541  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.9 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  29.79 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  29.33 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  44.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  28.27 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  28.11 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  31.18 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  26.05 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  28.26 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  28.26 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  26.5 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  30.34 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  28.45 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>