More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6851 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  45.73 
 
 		 257 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  37.39 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  38.84 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  32.41 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  33.61 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 302 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  32.4 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  47.66 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  47.66 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  32.4 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  39.45 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  30.13 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  29.94 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1541  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  26.12 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  30.34 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  25.88 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  31.87 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  24.37 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  30 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  27.47 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  28.57 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  28.14 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.29 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  27.71 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  27.64 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.43 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.33 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  27.68 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  34.58 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  24.7 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  29.17 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  27.64 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  27.64 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  30.47 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  30 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  27.31 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  29.51 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  30.49 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  30.96 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  25.93 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  28.28 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  44.58 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  24.58 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4146  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.994574  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  26.89 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.67 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  27.56 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  36.99 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  43.9 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  43.9 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>