More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5729 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  99.65 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  84.62 
 
 		 282 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  83.09 
 
 		 281 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  72.29 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  71.54 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 278 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  65.62 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  65.62 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 282 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  49.8 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 277 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  47.79 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  40.82 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  37.69 
 
 		 248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  37.94 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  38.13 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  37.74 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  37.89 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  35.09 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.66 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 249 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  29.58 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 235 aa  89.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.36 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 230 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.74 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  36.11 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.65 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  29.82 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.73 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  26.97 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  31.47 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  34.52 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.47 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  27.85 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  29.75 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  29.58 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  28.95 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  26.96 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  30.26 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  27.88 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  31.19 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  34.16 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.39 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  30.53 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  26.84 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  30.32 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.87 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  29.28 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  30.68 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.12 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  29.15 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  27.15 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.03 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  27.12 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.09 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  23.68 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  26.17 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  27.71 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.9 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.04 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  29.41 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  31.82 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.49 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  27.35 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  27.35 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  28.45 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  38.76 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>