More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4148 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 302 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  39.44 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  40.65 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  38.4 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  40.4 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 340 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  39.17 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  39.17 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  36.02 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  35.39 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  34.45 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  34.89 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.7 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  31.14 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  29.88 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  28.94 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.8 
 
 		 235 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  32.27 
 
 		 501 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  31.92 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  28.12 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  26.87 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  27.23 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  27.66 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  29.96 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  27.23 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  27.12 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  32.09 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  28.25 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  30.34 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.47 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  28.57 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  30.08 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.29 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  31.03 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  29.6 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  26.61 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  29.66 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  27.12 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  27.12 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  32.88 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.09 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  25.65 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  27.82 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  30.8 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  29.81 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  26.16 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  26.16 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3580  GntR domain protein  26.51 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  27.43 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  26.38 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.57 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  29.91 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  25.53 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  30.54 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  25.74 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  29.6 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  28.26 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  26.05 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  30.54 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  29.6 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  29.6 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  29.6 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  28.33 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>