More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1495 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  48.61 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  46.82 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3081  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2845  transcriptional regulator, GntR family  46.75 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0599584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  29.89 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  41.58 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  37.07 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  28.04 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>