More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4270 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4270  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4165  GntR domain-containing protein  58.9 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218155  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  39.09 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  37.73 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  37.99 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  35.71 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1565  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  32.41 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.78 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  31.03 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  31.03 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  32.38 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  32.38 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.38 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.38 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.38 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.38 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.38 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5994  GntR-like protein  30.81 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  30.63 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  32.52 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.52 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4185  GntR domain-containing protein  40.74 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  28.82 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  28.82 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  39.22 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.66 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.15 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.15 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.68 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  32.84 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  28.83 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  25.62 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.76 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  29.2 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.56 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  30.09 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  28.76 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  28.89 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.64 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.2 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  32.23 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  29.65 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  29.72 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.2 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.2 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.64 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  29.65 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  29.65 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  28.76 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  29.72 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.2 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.64 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  29.65 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1711  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00570567  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  32.09 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.56 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  28.51 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  28.32 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  28.32 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  28.32 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  29.2 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  28.32 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  29.2 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.2 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  28.32 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  29.2 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.74 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  33.19 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  29.61 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  33.33 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.95 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.76 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.7 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>