More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1711 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1711  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00570567  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  47.39 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  47.39 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5994  GntR-like protein  42.79 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  33.67 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 226 aa  95.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  28.04 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  31.6 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1565  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  29.86 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  31.58 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  28.57 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.75 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.57 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  27.23 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  29.44 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  27.23 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  27.05 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  27.23 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  25.86 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  25.86 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  25.86 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  25.86 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4185  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  26.64 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  28.43 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.67 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  28.25 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  26.64 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  27.46 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.83 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  29.09 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  27.46 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  27.46 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  27.8 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  26.83 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4165  GntR domain-containing protein  30.81 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218155  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  25 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4270  hypothetical protein  30.05 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  30.14 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  26.24 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  29.03 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  28.38 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  29.58 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  28.37 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  25.79 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  27.45 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  26.96 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  22.33 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  28.43 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  27.8 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  28.29 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  24.23 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  27.6 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  26.85 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  23.98 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  27.6 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  29.82 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  25.75 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  26.79 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  27.23 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  24.34 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  26.77 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>