More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4102 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  70.43 
 
 		 238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  45.09 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  44.3 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  38.21 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  36.84 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4270  hypothetical protein  39.09 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5994  GntR-like protein  33.18 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.74 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1711  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00570567  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.63 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  30.45 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1565  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  30.91 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  32.19 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.31 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  33.85 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  33.18 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  30.04 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.2 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  33.96 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.06 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.05 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  33.97 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  31.9 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.78 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.54 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4165  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218155  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  30.05 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.9 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  31.73 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  30.05 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  30.05 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.87 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.35 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  26.91 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  31.51 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  31.28 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.74 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  29.55 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  33.98 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4185  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.74 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.74 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  28.69 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.41 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  26.87 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  30 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.74 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.9 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.32 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  29.11 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  31.75 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  30.89 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  31.25 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  31.94 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.28 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.34 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  29.76 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.83 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  31.94 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>