More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2629 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 239 aa  335  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  55.32 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  45.09 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  43.64 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  33.49 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5994  GntR-like protein  33.67 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4185  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440271 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4270  hypothetical protein  35.71 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  31.73 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  31.73 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.52 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  34.18 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  37.85 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1711  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00570567  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  29.96 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1565  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31.94 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  36 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  32.24 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  35.5 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  30.4 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  35.87 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  35 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.31 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.39 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.09 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.92 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  34.67 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  34.67 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  32.66 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.62 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4165  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218155  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.22 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.88 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.16 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.7 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  30.67 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.39 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.39 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  27.35 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.65 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.61 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.89 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  29.17 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.44 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.37 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.55 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  29.36 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.91 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.37 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  34.33 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  34.18 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.37 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  30.43 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  28.14 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.61 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.9 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.5 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  28.82 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  28.82 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  28.82 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  30.28 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  28.82 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  29.49 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  29.49 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.29 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  31.66 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  30.52 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.3 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  29.49 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  34.74 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.13 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  27.18 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.18 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>