More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1699 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1699  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 513 aa  1024    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330463  hitchhiker  0.0000606357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 239 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.8 
 
 		 238 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.28 
 
 		 240 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 239 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 258 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.84 
 
 		 240 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.41 
 
 		 243 aa  90.9  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.98 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.66 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  31.28 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.3 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.53 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  28.12 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.08 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.08 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  29.68 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  25.81 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.08 
 
 		 258 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 247 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.81 
 
 		 237 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  31.08 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.53 
 
 		 258 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.63 
 
 		 258 aa  79.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  29.91 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.31 
 
 		 233 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.47 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.63 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.18 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  30.18 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.18 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  30.18 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  30.18 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.18 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  34.3 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.18 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.6 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  28.11 
 
 		 234 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 232 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 233 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  25.7 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  29.33 
 
 		 261 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  29.77 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  27.19 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.24 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  27.51 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  29.68 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  29.68 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  25.86 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  32.51 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  29.66 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  29.91 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 218 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  30.14 
 
 		 237 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 246 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  29.86 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  29.06 
 
 		 235 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  26.96 
 
 		 258 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  29.91 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  32.31 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.48 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  29.54 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.48 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  27.49 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  37.06 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  29.5 
 
 		 233 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 218 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>