More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1537 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  84.68 
 
 		 242 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.97 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  32.97 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  27.4 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.42 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.79 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.51 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.05 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  30.22 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.72 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.72 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.72 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  28.89 
 
 		 250 aa  98.6  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  30.7 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  35.75 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  31.84 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  30.12 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.75 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.57 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  30.12 
 
 		 253 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  26.46 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.65 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  30.14 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  31.14 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  28.44 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.09 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  28.76 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  27.85 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  27.56 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  28.32 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  27.01 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.95 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  26.54 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.7 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.4 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  27.68 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  27.52 
 
 		 222 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  28.51 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  28.51 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  28.51 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  28.44 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  32.2 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.18 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  26.96 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  32.92 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.61 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.28 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  25.32 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>