More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6022 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  88.93 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  83.59 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  71.92 
 
 		 282 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  72.29 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  72.29 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  72.29 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  63.85 
 
 		 279 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  63.85 
 
 		 279 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  64.34 
 
 		 278 aa  331  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  52.06 
 
 		 282 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  49.41 
 
 		 278 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  47.97 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  40.49 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  37.86 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  36.97 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  36.65 
 
 		 256 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  37.04 
 
 		 259 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  37.6 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  33.47 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  37.11 
 
 		 260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  38.19 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.84 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 218 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.2 
 
 		 250 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 249 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  36.42 
 
 		 267 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 268 aa  86.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  28.7 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  27.43 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  33.54 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  28.09 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  29.07 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.69 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  36.28 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  27.39 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  33.9 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  27.08 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  33.99 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.33 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  30.23 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.61 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  26.34 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  29.24 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  30.05 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  29.65 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.34 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.34 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  30.36 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  34.52 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  27.78 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  27.57 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  29.63 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  25.56 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  27.48 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  33.13 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  31.37 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  25.5 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  32.5 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  30.71 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  31.49 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2203  GntR domain protein  28.97 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>