More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0339 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  98.64 
 
 		 221 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  67.58 
 
 		 223 aa  271  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  67.28 
 
 		 225 aa  261  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  63.18 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  60.09 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  52.31 
 
 		 224 aa  194  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  54.36 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  51.16 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  59.44 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  49.28 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  50 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  51.87 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  49.54 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  46.89 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  52.58 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  42.33 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  46.8 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  45.83 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  44.22 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  41.15 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  39.27 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  38.77 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  44.86 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  41.86 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  43.91 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  40.78 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  40.27 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  36.54 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  44.29 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  38.6 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  40.1 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  42.86 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  38.14 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  39.3 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  35.75 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  36.7 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  38.22 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  33.97 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  45.73 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 240 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.89 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  39.16 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.56 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.51 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.99 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.26 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  35.71 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 249 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 252 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.88 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  28.25 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  30.12 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  36.76 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  39.38 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  35.32 
 
 		 251 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 274 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28.74 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.74 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 255 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.73 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.58 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  35.8 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 257 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  37.42 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.49 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  32.02 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  41.88 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  36.99 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.77 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  36.67 
 
 		 249 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>