More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1051 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  64.32 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  56.68 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  49.77 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  46.54 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  48.34 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  47.69 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  43.93 
 
 		 226 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  44.44 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  46.97 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  49.13 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  39.44 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  47.64 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  44.66 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  41.51 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  43.38 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  38.71 
 
 		 226 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  46.11 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  40.37 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 337 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.64 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  41.71 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  39.91 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  38.53 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  42.47 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  42.45 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  43.41 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  37.44 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  37.33 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  34.91 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  36.41 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  31.22 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  36.14 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  41.92 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  30.39 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  35.21 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.11 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 264 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 245 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 261 aa  88.2  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  34.86 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  28.51 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.81 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  32.84 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  36.96 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  34.89 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.47 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.88 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  32.99 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  30.56 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  33 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.82 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  33 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  35.54 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  31 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.14 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>