More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3975 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  59.31 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  58.33 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  54.19 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  52.81 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  51.15 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  59.17 
 
 		 262 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  56.02 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  54.07 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  49.11 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2450  GntR family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 246 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  44.34 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6827  GntR domain protein  44.95 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  36.65 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  40.27 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  36.28 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  35.81 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  37.33 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  35.34 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  31.67 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  36.48 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  31.67 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  30.33 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  32.11 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  34.93 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  38.73 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  36.81 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  36.81 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  36.81 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  35.91 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  37.9 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  29.96 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  36.87 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  33.8 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  35.91 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  37.85 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  29.85 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  29.15 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  34.21 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  34.42 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 192 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  32.59 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  35.48 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  30.63 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  28.17 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  28.17 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  28.17 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  33.62 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  27.96 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  27.96 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  27.96 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>