More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2015 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  79.91 
 
 		 232 aa  335  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  57.08 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  50.45 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  50.91 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.46 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.42 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.17 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  35.29 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  35.45 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.95 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.08 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  33.88 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  33.88 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  33.88 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  32.79 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.56 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  29.65 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.88 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  34.02 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30.63 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  32.41 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  29 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.67 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.67 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.67 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.67 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.67 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 269 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  32.73 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.87 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.19 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.96 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  30.26 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  30.53 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  30.04 
 
 		 263 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  30.53 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  30.04 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  30.04 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  30.04 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  30.04 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.91 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.91 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  31.6 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2203  GntR domain protein  29.82 
 
 		 261 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.91 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  31.91 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.91 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  30.09 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  30.09 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.09 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.47 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  30.09 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.13 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 272 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  27.68 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  28.37 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  33.49 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  29.91 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  33.8 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.18 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.46 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>