More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2845 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2845  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 174 aa  350  8e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0599584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  43.36 
 
 		 248 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  42.75 
 
 		 224 aa  103  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  47.95 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  94.4  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 239 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 217 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 248 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 214 aa  85.5  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 221 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 222 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  84.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 222 aa  84.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  34.97 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  38.85 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  41.61 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  33.11 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  41.73 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  33.57 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  41.73 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  41.73 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 251 aa  77.8  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 247 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  34.04 
 
 		 229 aa  77.4  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  72  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  36.81 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  36.81 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  35.53 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 290 aa  71.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  48.24 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 222 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  38.76 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  35.11 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>