More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2320 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 232 aa  117  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 267 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  32.68 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.94 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 247 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  35.6 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 236 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  28.99 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 239 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  31.34 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>