More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4050 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  82.53 
 
 		 230 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  63.32 
 
 		 230 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  60.87 
 
 		 230 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  60.7 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  58.22 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  58.22 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  57.33 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  58.37 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 229 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  51.79 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 260 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  38.01 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  36.96 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  30.73 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>