More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0790 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0790  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0794  transcriptional regulator, GntR family  50.23 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.133446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  48.37 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  24.04 
 
 		 269 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  24.76 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  24.49 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  23.44 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  24.49 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  40.26 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  23.47 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  23.56 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  24.09 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  23.78 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  23.72 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  23.13 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  22.22 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  26.2 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>